達(dá)爾文的第一次冒險，就是他那著名的乘坐海軍勘探船“貝格爾號”的五年環(huán)球考察。什么是他的第二次冒險？——娶老婆是也！對于婚姻大事，達(dá)爾文也有著科學(xué)家的謹(jǐn)慎。他拿了一張紙，中間劃條線，線的一邊寫結(jié)婚的好處，另一邊寫單身的好處。達(dá)爾文感嘆不結(jié)婚太孤單，然后連寫三個“結(jié)婚”——證明完畢，必須結(jié)婚。
達(dá)爾文顯然是個性格溫和的人，喜歡和女人閑聊，他就是要找傳統(tǒng)的賢妻良母。他并不是沒有別的選擇。朋友家的三位女兒，個個博學(xué)聰明，能跟他辯論哲學(xué)和科學(xué)，更能容納他的懷疑論。他找上了從小認(rèn)識的表姐愛瑪·韋奇伍德。愛瑪比達(dá)爾文大一歲，她的父親是達(dá)爾文母親的弟弟。愛瑪一口答應(yīng)達(dá)爾文的求婚——這個愛聽女人嘮叨的男人，女孩子似乎都當(dāng)他理想丈夫材料。雖然愛瑪擔(dān)心死后會和丈夫永遠(yuǎn)分手，她將上天堂，不拜上帝的丈夫則不知去何方，她也只是要求達(dá)爾文對信仰保持開放心態(tài)。兩個半月后，他們就結(jié)婚了。
女兒安妮的去世未能摧毀達(dá)爾文的婚姻。在愛瑪?shù)臅r代，女兒安妮的病故很容易被認(rèn)作是對自己“不道德”行為的懲罰，比如說，嫁了一個不信上帝的男人。但愛瑪從未如此認(rèn)為。兩人都深愛安妮。眼見安妮停止呼吸，達(dá)爾文自己也病倒在床。他對愛瑪說：我們更要互相珍重。愛瑪答道：你要記住，你永遠(yuǎn)是我最珍貴的寶藏。每到周日，他陪著愛瑪和孩子走到教堂。妻子帶孩子進(jìn)去做禮拜，達(dá)爾文卻孤身在鎮(zhèn)中散步。
愛瑪未必同意《物種起源》中自然選擇的觀點（而不是上帝創(chuàng)造），或許她都未必感興趣。但也正因為如此，愛瑪可以代表當(dāng)時的未受過科學(xué)教育的信教大眾，對《物種起源》手稿作出第一反應(yīng)。愛瑪仔細(xì)閱讀了手稿，改正拼寫，改正標(biāo)點，并建議達(dá)爾文將一些容易刺激信徒和教會的段落寫得語氣溫和一些，論據(jù)更清楚一些。
如果當(dāng)初不結(jié)婚的那一欄里理由再多一些，如果達(dá)爾文保持單身，繼續(xù)生活在倫敦的知識分子中間，如果不是和愛瑪結(jié)婚，他很可能寫出一本較為激烈的書。由于愛瑪?shù)膮⑴c，對書中觀點的爭論，多少能擺脫感情的羈絆，而集中于事實和邏輯。
《物種起源》初版于1859年。十二年后，達(dá)爾文又出版了《人類的由來》一書。不管人猿同源如何有爭議，《人類的由來》一書，顯然對達(dá)爾文夫妻的感情毫無影響。這本書出版后不久，他們存活下來的最大的女孩子埃蒂嫁人了。達(dá)爾文告訴她：我有一個幸福的人生，這要完全歸功于你的母親——你應(yīng)以母親為榜樣，你的丈夫?qū)勰阌腥缥覑勰愕哪赣H。
達(dá)爾文早于愛瑪十四年去世。有一個傳說，說他在去世前皈依了信仰。或許，是為了安慰愛瑪?shù)奶焯貌坏孟嘁姷谋瘋�？沒有這回事。在愛瑪?shù)娜沼浝�，未曾發(fā)現(xiàn)此類記錄。達(dá)爾文至死是一個堅持自己立場的科學(xué)家。
兩個至死在最重要的意識問題上互不改變的人，相親相愛，過了一輩子。
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