華大基因研究院表示，德國大腸桿菌疫情暴發(fā)之后，該研究院成立專門研究小組對(duì)該細(xì)菌進(jìn)行測序和生物信息學(xué)分析，以便盡快尋找到致病機(jī)理。在獲得病毒樣本后三天的時(shí)間內(nèi)，華大基因完成了對(duì)該新型大腸桿菌的基因組測序。經(jīng)過初步信息分析，發(fā)現(xiàn)該菌株是一種新的兼具侵襲、產(chǎn)毒、腸出血等特征的大腸桿菌。
華大基因利用第三代測序儀進(jìn)行了該大腸桿菌的全基因組測序。通過對(duì)序列的分析發(fā)現(xiàn)，該菌株屬于血清型O104，但O104型大腸桿菌以前未見引起人類感染大規(guī)模暴發(fā)的報(bào)道。通過進(jìn)一步比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)，該菌株與2002年從中非艾滋病患者腹瀉標(biāo)本中分離的腸侵襲性大腸桿菌55989菌株的同源性超過93%。根據(jù)對(duì)基因序列的分析結(jié)果顯示，導(dǎo)致疫情暴發(fā)的菌株通過基因水平轉(zhuǎn)移獲得了腸出血性大腸桿菌的毒力基因和毒力相關(guān)質(zhì)粒，可能與該菌株強(qiáng)毒性和重癥感染有關(guān)。
研究還發(fā)現(xiàn)，該菌株攜帶氨基糖甙類、大環(huán)內(nèi)酯類、磺胺類等抗生素的耐藥基因，導(dǎo)致抗生素治療無效。深圳華大基因研究院表示，該院正在和中國疾病預(yù)防與控制中心、中國軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所合作，進(jìn)一步分析這些毒力相關(guān)基因的完整性和表達(dá)情況、耐藥和毒力基因水平轉(zhuǎn)移機(jī)制，并在更多暴發(fā)菌株中進(jìn)行驗(yàn)證。
據(jù)德國衛(wèi)生部公布的數(shù)據(jù)，這場大腸桿菌疫情至今已導(dǎo)致17人喪生。連日來，腸出血性大腸桿菌也蔓延到其他不少歐洲國家和美國。據(jù)世界衛(wèi)生組織公布的最新統(tǒng)計(jì)，除德國外，已有奧地利、丹麥、法國、荷蘭、挪威、西班牙、瑞典、瑞士、英國和美國等國報(bào)告了腸出血性大腸桿菌感染病例或其嚴(yán)重并發(fā)癥。 相關(guān)閱讀